Ученые создали универсальный «хронометр» старения и смертности
Международный коллектив, включающий ученых факультета биоинженерии и биоинформатики, НИИ ФХБ имени А.Н. Белозерского МГУ и Гарвардской школы медицины, опубликовал в журнале Nature работу, которая попала на обложку номера. Исследователи разработали универсальные транскриптомные часы (tAge) – биоинформатический инструмент, который по результатам анализа активности нескольких тысяч генов предсказывает возраст, ожидаемую продолжительность жизни и риск хронических заболеваний, а также помогает обнаружить омоложение организма на ранних стадиях эмбрионального развития, при репрограммировании клеток и при объединении кровотоков старой мыши и молодой.
Как работают новые часы и чем они отличаются от «старых»
В биологии старения важную роль играют так называемые «часы старения» – сложные математические модели, которые по тем или иным биомаркерам (например, на основе информации о химических метках в ДНК, данным о физической активности, анализу крови или даже по внешнему виду человека) способны с определённой погрешностью определять хронологический, то есть «календарный» возраст организма. Однако эти часы обычно плохо предсказывают, как то или иное воздействие (например, диета, фармакологические препараты или генетические манипуляции) сказывается на продолжительности жизни животного или человека. Новые транскриптомные часы (авторы назвали их tAge) анализируют другой параметр – уровень экспрессии генов: то, какие гены в данный момент «выключены», а какие работают и с какой интенсивностью. Кроме того, модель выделяется масштабностью: в её обучении авторы использовали данные более чем 11 000 образцов, соответствующих 25 типам тканей и органов из четырёх видов млекопитающих. Причём часть этих образцов имела отношение к животным с искусственно изменённой продолжительностью жизни, благодаря чему часы tAge улавливают тонкие изменения, связанные со здоровьем, болезнями и действием потенциальных геропротекторов.