Предложен экспресс-метод для отбора древних костей по содержанию углерода
Исследователи Южного федерального университета разработали метод, который позволяет за несколько часов и с минимальными затратами определить, сохранилась ли в древних костных останках ДНК, пригодная для генетического анализа.
Ученые установили количественные зависимости успешности выделения и типирования древней ДНК от содержания органического углерода в костной ткани. Этот подход поможет палеогенетикам по всему миру экономить время и ресурсы, отбирая для дорогостоящих исследований только самые перспективные образцы.
Каждый из нас — это примерно 16 килограммов углерода. Именно этот элемент составляет основу наших клеток, ДНК и белков. И когда человек уходит, в земле остаются его кости, в которых сохраняются молекулы — остатки того самого углерода, из которого когда-то была собрана жизнь. Извлечь эти молекулы, «прочитать» их и восстановить историю давно ушедших людей — задача современной палеогенетики. Но спустя столетия понять, сохранилась ли в древних останках ДНК, пригодная для анализа, — непросто.
По словам ученых, работа с древней ДНК всегда лотерея. За сотни и тысячи лет молекулы нуклеиновых кислот разрушаются, фрагментируются и химически модифицируются. Даже если образец выглядит хорошо, это не гарантирует, что в нем сохранился генетический материал, пригодный для анализа. А каждый такой анализ — процесс трудоемкий и дорогостоящий.
Ученые Южного федерального университета под руководством сотрудников ЮНЦ РАН апробировали методику предварительной «сортировки» археологических образцов, которая позволяет с высокой вероятностью предсказать успех исследования. В работе были изучены костные останки из курганов Ростовской области, датируемые VII–IX веками и принадлежащие представителям Хазарского каганата.
Исследователи измерили содержание общего органического углерода (ТОС) в костных фрагментах и сопоставили эти показатели с успешностью выделения ДНК и последующего генотипирования. Выяснилось, что чем выше содержание органического углерода в кости, тем больше шансов получить полноценный генетический профиль.