Ученые расшифровали стратегию защиты картофеля от жары и засухи
Ученые Сибирского федерального университета приняли участие в исследовании генетических механизмов, позволяющих картофелю и томату приспосабливаться к засухе и жаре.
Результаты исследования помогут в селекции наиболее устойчивых к глобальному изменению климата сортов этих распространённых овощных культур.
Изменение климата и прогнозируемое климатологами повышение температуры на 1-7 °C к концу столетия увеличат частоту засух, что несёт риски снижения урожайности и требуют нового подхода к селекции растений, устойчивых к новым климатическим реалиям. Исследование красноярских и новосибирских учёных посвящено тому, как на уровне экспрессии генов картофель (Solanum tuberosum) и томат (Solanum lycopersicum) реагируют на засуху и жару и какие элементы этой реакции можно отнести к общим (консервативным), а какие присущи конкретному виду растений.
«Массовый метаанализ множества экспериментов представлен в открытых базах данных. Этими данными были результаты RNA-seq — это такой метод, который позволяет определить, какие гены „работают“ активнее или слабее путем подсчёта количества РНК/транскриптов у образцов, выращенных в разных условиях (опытных — перенесших стресс и контрольных — выросших в благоприятных условиях). Всего было проанализировано 450 RNA-seq образцов (картофель и томат, подвергшиеся засухе и жаре в контролируемых экспериментальных условиях). В итоге получили воспроизводимые наборы генов, менявших свою экспрессию в ответ на стресс. Эти гены, по нашему мнению, могут быть потенциальными мишенями для будущих исследований и селекции», — рассказала соавтор исследования, научный сотрудник лаборатории лесной геномики, доцент кафедры геномики и биоинформатики СФУ Евгения Бондар.